经历了前作的一系列事件而迅速成长的艾丝蒂尔、离开了艾丝蒂尔的约修亚，以及利贝尔王国的命运以及在理查德政变事件的背后蠢蠢欲动的神秘组织“噬身之蛇”的真身和前作遗留下来的诸多谜团等等，都会在SC揭开。剧情的文字量比前作大幅上升，通过大量的故事情节和过场动画，让游戏的故事以更具动态、更为壮观的形式进行。