《苍之彼方的四重奏》故事讲述人们发现了一种不可思议的反重力粒子，人们用这种粒子发明各种反重力装置。 包括反重力鞋令人们生活非常方便，就像骑自行车般简单可以随心所欲在天空飞行，一种名为Flying Circus(飞行马戏)的运动亦随之而诞生。

　　本作主角是一位在小时候相当被看好的Flying Circus选手，因其中一次比赛中遭受到压倒性的败北而受挫，主角在上学途中遇到转校生仓科明日香，因缘际会下再次使用反重力鞋而重新燃起对FC的热情，因而展开一段青春的恋爱物语。