磁盘与各I/O设备接口
X99作为脱胎于服务器芯片组的主板，存储扩展功能自然爆棚，而微星X99A PRO滴水不漏地将其实现在主板上。
磁盘接口
X99A PRO一共提供10个SATA3.0接口，包括构成SATA-Express的两个（画面外）。此外它还提供两个Intel规范的高速U2磁盘接口，尽管使用率不高，但为玩家打造超高速磁盘系统创造了可能。
作为一款旗舰芯片组产品，M.2插槽是必不可少的
后I/O面板特写
I/O端口功能十分丰富，提供四个USB3.0接口，两个USB3.1，四个USB2.0。其中USB3.1主控连接PCI-E2.0 2×通道，带宽达10Gb/s，接口做成Type-C的形式，可插拔不分正反，理论允许承受100W的功率，可谓是未雨绸缪。
音效区块
拆掉防护盖
微星X99A PRO主板上的声卡是其引以为傲的Audio Boost音效系统，是整合高档螃蟹板载芯片和纳美音频技术的产物，支持8声道高清音频输出和高阻抗耳机。
