战斗系统
战斗的操作和原来没有太大变化，左下角的图标中间为使用的机师，人物左边是爆种后消耗的气槽，右边三条从上到下分别是推进器的气槽用过后会出现一段补充时间；下面是血量槽；最后是无双气槽，右上角是地图同时战场信息会随时在屏幕下方显示。当角色进入爆种或变身形态后在左边气槽使用完或发动一次无双后结束该形态。
爆格不够热血
本作也是可以在战斗中换装，在SEED两个剧本中主角机都有三种形态随时可以切换，换装键在不同的C技中使得更换便捷，不过唯一一个缺点是换装时比如搭载火炮和推进器的一瞬间会有几下震动手柄，因为在敌方人群中换装是随时伴随的总觉得那几下震动是受到了攻击，所以手柄开震动的话被攻击和换装震动容易干扰稍微有些影响流程度。
通过每个关卡后玩家还是可以获得如下图的零件强化，当然也可以卖掉换成金钱。消耗一定的道具数值也可以学习新的技能来强化自己，在讲座的图标上点击可以进入训练和讲座内容，相当于花钱买一些升级用的经验和学习技能用的数值。
机体部件
提升能力的界面也很大不同
