飞碟拦截战算是另一种任务的开端，当战机成功击落飞碟后，便要派人前往该地进行搜索与歼灭任务。

挺进飞碟内部搜索时，得要注意突然冒出来的外星人。

当玩家逐渐摸透所有基地设施之后，接下来要学习的就是如何“培养”战士。因为《幽浮：未知敌人》能让战士经由参战来获得经验升级，而升级后便能学习各种不同的技能，不过还有一点得要特别注意，战士所获得的经验值皆为独立计算外，若该名战士不幸战死沙场，一切的栽培全都会被没收，简单来说，战士死了就死了，除了重新读取进度完全没有转寰余地，你也只能在纪念碑上吊唁他们，这就是《幽浮：未知敌人》自古以来最硬派的部份。因为好不容易让他们活过数场战争升级为少校以上，却在下一场出任务时残死在外星人手上，那可真的会令人气到想摔手把，不是吗？

前人的英勇殉职，会永远挂在基地里的纪念碑上，愿上帝怜悯他们的灵魂。