剧情 (8.5分)：
玩家在AP只有一个身分：特工-------Michael Thorton(Mike)，一个刚加入Alpha Protocol(一个位处美国的秘密组织)的新成员。你的第一个任务就是调查中东的恐怖分子用来击毁民航客机的导弹是从何以来，并阻止同类事件的再次重演。完成训练后，玩家会前往沙特阿拉伯走访当地入军火商、以武力闯入空军基地...后，Mike终于找到该次恐怖袭击的原凶Shaheed，并阻止了他将本使用的导弹运往别处。但就在此时，天上却又飞来几颗导弹，大命的你就这样被自己的组织所舍弃了...
为了查出背后的真相、手刃仇人。 Mike决定在Mina的协助下暗地里前往台北、莫斯科、罗马调查一个被称为Halbech的军火供应商。期间玩家一次又一次地与三地的黑道、帮派、组织(eg NAC, VIC, G22, CSP,...)牵连上，与一个又一个不知是敌是友的陌生人交换情报，每个在对话中的选择都会微妙地影响/改变着故事的走向，最后玩家究竟是还自己一个清白将Halbech消灭、或是被人悬红追杀，又或是无意中反被其他组织利用了而不自知...
