6、X教授复活之谜
X教授在《X战警3：背水一战》结尾复活了，但是大家都纳闷明明X教授的身体已经被粉碎了。
粉丝猜测，X教授借尸还魂的身体是他瘫痪的孪生兄弟，后来这个粉丝猜测在《金刚狼3》的蓝光评轨中得到了证实。不过在漫画里，X教授只有一个孪生姐姐，并没有兄弟。
这也是官方后期补的彩蛋了，福斯当时也没有想好后面的剧情怎么编，因为《X战警3》的拍摄过程特别不顺利，先是原来的导演布莱恩·辛格退出，换了《尖峰时刻》导演布雷特·拉特纳。
再者，镭射眼的饰演者詹姆斯·麦斯登参演《超人归来》，所以档期紧张，这导致镭射眼在X3的戏份特别少;魔形女饰演者丽贝卡·罗梅恩因为染料过敏也想退出，所以魔形女的戏份也特别少。
原定妮可·基德曼饰演白皇后的计划也作罢，原剧本中的白皇后vs黑凤凰的大戏也泡汤了;幻影猫饰演者艾伦·佩吉被导演性骚扰，导演甚至言语羞辱佩吉的性取向。
总之，当时的福斯差点就放弃了再继续拍摄《X战警》的打算。后来也是在凯文·费奇坚持，才有了后来的《金刚狼前传》。
