来到「机密单位」的卡特，在Faulke的解说下才知道这个机密单位就是对付苏联的「The Bureau（调查局）」，原本成员只有少数菁英，但在外星人大举入侵之下，「调查局」立刻用早就准备好的「口袋名单」从各界征募人才，卡特就是其中一员（而且还是CIA局长胡佛亲自推荐！）。而从此之后，「调查局」直接改组成「XCOM」，成为对抗外星人的终极防线。
一看就知道不单纯的组织...
XCOM迷听到这句话应该会心头一震吧！
趁机偷看一下卡特的档案。
这时卡特终于可以自己挑选干员与任务了。玩家可以挑选最多两个干员同行，队员共有「突击兵」、「侦查兵」、「支援兵」、「工程师」四种兵科，每种兵科能装备的武器与技能都不同。卡特与干员都会随着任务执行而升级，不但体力值会上升，还能学会更强力的技能。所以与其说《调查局：幽浮解密》是TPS，还不如说它是包了TPS外皮的RPG。另外要特别注意的一点，是干员一旦在任务中死亡就无法复活了，而且如果卡特旗下的干员如果全死光，游戏就会直接结束！如何？不敢派部属去送死了吧？
支援兵（Support）：初期技能是强化特定范围内我方成员的攻击力。
侦查兵（Recon）：初期技能是强悍的致命射击。
工程师（Engineer）：初期技能是让一定范围内的敌人陷入混乱。
突击兵（Commando）：初期血比别人多一格，技能是挑衅外星人吸引注意力。
我们的主角卡特！只有他可以装备两把枪与副武器！
每个职业能装备的枪都不一样。选择最顺手的枪吧。
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